Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1924080	1924921	842	81 [0]	[0] 20	[pphA]	[pphA]

GTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCAA  >  W3110S.gb/1924011‑1924079                                                                     | gTACGGTTATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1124319/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTTATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1266947/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCCCCGGTATCaa  <  1:1449562/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGTTATCaa  <  1:3550/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:501462/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:619603/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:599919/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:568473/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:563990/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:554735/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:533705/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:521818/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:515450/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:50673/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:641293/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:468758/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:448926/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:406657/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:375166/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:347999/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:237363/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:178570/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:875007/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:964712/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:952983/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:948390/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:946588/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:913991/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:913510/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:906818/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:887286/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:879297/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1588522/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:858239/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:844042/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:843999/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:830869/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:822435/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:754237/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:709539/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:650170/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1145021/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1322779/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:173398/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1238967/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1215579/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1204410/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1185910/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1185294/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1180254/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1265175/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1142688/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:113906/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1102084/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1082374/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1075698/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1067291/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1060000/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1017460/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1387785/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1559522/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1501257/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1480373/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1470936/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1470049/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1337953/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1443031/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1427252/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:156507/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1377264/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1375787/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1584113/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1339876/69‑1 (MQ=255) gTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1011827/69‑1 (MQ=255)  tACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1153725/68‑1 (MQ=255)  tACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:315303/68‑1 (MQ=255)  tACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1193317/68‑1 (MQ=255)  tACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1292628/68‑1 (MQ=255)      gTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:953820/64‑1 (MQ=255)                                 agagTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1256775/37‑1 (MQ=255)                                   agTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCaa  <  1:1342576/35‑1 (MQ=255)                                                                     | GTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCCCCAAAGACAGCACCGGTATCAA  >  W3110S.gb/1924011‑1924079

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑