Missing coverage evidence...
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TACCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAG  >  W3110S.gb/1955728‑1955795                                                                    | tACGGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:392134/68‑1 (MQ=255)  atcGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:1439007/65‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGTAAg  <  1:635817/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:56584/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:436320/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:438941/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:441409/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:452241/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:459806/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:463556/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:484548/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:500900/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:289067/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:586263/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:633172/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:659282/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:679158/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:689995/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:759295/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:815651/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:86367/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:873348/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:1434456/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:1016801/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:1062743/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:1138951/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:1152789/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:1178164/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:1181597/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:1210342/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:1311348/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:1341462/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:1386741/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:339229/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:1444789/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:1480667/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:1583994/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:164836/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:225761/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:239091/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:24769/67‑1 (MQ=255)  aCCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:1014681/67‑1 (MQ=255)       cTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATAGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAg  <  1:1538810/62‑1 (MQ=255)                                                                    | TACCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAG  >  W3110S.gb/1955728‑1955795

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑