Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1967270	1967287	18	70 [0]	[0] 256	flhB	predicted flagellar export pore protein

GAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAA  >  W3110S.gb/1967227‑1967269                                           | gAATATCCTGCCGTGACATTCGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:291779/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  >  1:458496/1‑43 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:629332/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  >  1:622439/1‑43 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  >  1:574026/1‑43 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:566489/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  >  1:551881/1‑43 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:546760/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:542324/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:505443/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  >  1:643742/1‑43 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:422937/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:406126/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:355341/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:334294/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:302299/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:233830/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  >  1:822149/1‑43 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  >  1:1013204/1‑43 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:984999/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:97895/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  >  1:975337/1‑43 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:956377/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  >  1:932997/1‑43 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:90880/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:900349/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:987573/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  >  1:777331/1‑43 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  >  1:747536/1‑43 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:747024/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:68079/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  >  1:672724/1‑43 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  >  1:663746/1‑43 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:654910/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  >  1:1144886/1‑43 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:1326753/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  >  1:132079/1‑43 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:1290153/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:1261970/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:1239474/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:1221111/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:1190566/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:1148924/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  >  1:163612/1‑43 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  >  1:1127996/1‑43 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:1093567/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:1064166/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:1060293/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:1033951/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:1032236/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:1015848/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  >  1:1547825/1‑43 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:187433/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:163305/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  >  1:1607150/1‑43 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  >  1:1605243/1‑43 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  >  1:15920/1‑43 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:1580111/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:1578762/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  >  1:156060/1‑43 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:1397391/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  >  1:1529625/1‑43 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:152912/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  >  1:1523848/1‑43 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:1464231/43‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  >  1:14060/1‑43 (MQ=255) gAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTAAGGTGGCTGaa  >  1:746088/1‑43 (MQ=255) gAATATCCTGCCGGGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:146905/43‑1 (MQ=255)  aaTATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:320850/42‑1 (MQ=255)  aaTATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGaa  <  1:648924/42‑1 (MQ=255)                                           | GAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAA  >  W3110S.gb/1967227‑1967269

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑