Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1977769	1978311	543	92 [0]	[0] 114	[motB]–[motA]	[motB],[motA]

GTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGT  >  W3110S.gb/1977700‑1977768                                                                     | gtAGTCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:1511044/1‑69 (MQ=255) gtAATCATGACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTTGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:456984/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCCCCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:1431322/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATTCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:928999/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCTCCCGTAACCGCAGt  >  1:1142436/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCTGTAACCGCAGt  >  1:135886/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:590626/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:679835/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:671505/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:664586/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:650797/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:64892/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:628550/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:607183/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:600286/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:590942/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:700505/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:581322/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:579494/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:571095/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:556893/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:555613/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:542993/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:532147/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:500404/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:487453/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:82410/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:968097/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:9586/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:950867/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:942205/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:934035/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:904766/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:880747/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:86334/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:857343/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:843442/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:688363/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:818106/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:793586/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:767304/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:763968/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:761334/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:752639/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:75138/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:709819/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:478576/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:69210/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:1180044/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:48680/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:1396480/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:1395608/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:1361757/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:133065/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:1324779/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:1297594/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:1283409/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:1261495/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:1202055/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:144149/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:1155319/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:1138372/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:1131835/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:1108180/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:1088348/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:1074206/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:1062574/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:1060664/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:1050237/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:1037492/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:226932/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:483106/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:1012875/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:477322/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:425256/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:33654/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:315538/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:312400/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:311396/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:248360/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:230366/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:1448234/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:204485/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:202281/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:1586616/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:1575074/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:1530941/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:1509478/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:1507243/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:1479625/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGACCGTAACCGCAGt  >  1:834527/1‑69 (MQ=255) gtAATCATCACCACCGCCGGGAAATGCGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt  >  1:1488297/1‑69 (MQ=255)                                                                     | GTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGT  >  W3110S.gb/1977700‑1977768

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑