Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2003992 2004173 182 128 [0] [0] 42 fliA/fliC RNA polymerase, sigma 28 (sigma F) factor/flagellar filament structural protein

Only 100 of 128 total aligned reads displayed.

TCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCG  >  W3110S.gb/2003923‑2003991
                                                                    |
tCACGTTAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:213867/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:471522/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:581921/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:576566/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:574393/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:562289/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:535772/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:532269/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:524235/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:490122/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:489810/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:479754/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:472559/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:599540/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:46655/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:455789/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:455303/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:450937/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:443114/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:42452/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:414858/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:318882/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:318525/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:301922/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:850421/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:995158/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:981300/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:974741/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:957790/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:956985/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:948862/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:910442/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:906378/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:902230/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:887575/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:882195/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:387994/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:849652/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:774202/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:758160/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:734856/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:734115/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:68452/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:680041/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:622382/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:621740/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:60702/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1153098/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1372274/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1360925/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:297789/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1298616/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1267248/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1252765/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1218959/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1217745/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1193810/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1173501/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1168187/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:134930/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1137471/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1115463/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1114102/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1107927/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1105774/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1097968/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1089072/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1075218/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1046869/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1040268/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1452971/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:28873/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:282880/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:272976/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:271171/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:256455/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:231833/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:219613/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:17933/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1606104/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1585028/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1551505/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1487490/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1412037/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1457216/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1463485/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1472341/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1510126/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1493141/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1508271/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGATTTTTAATCg  <  1:958922/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGATATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAACCg  <  1:684860/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGCGTTAAATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:650025/69‑1 (MQ=255)
tCACGATAAACAGCCCTGAGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:810700/69‑1 (MQ=255)
 cACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:828352/68‑1 (MQ=255)
 cACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1020593/68‑1 (MQ=255)
 cACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:287634/68‑1 (MQ=255)
    gATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:821864/65‑1 (MQ=255)
                 gCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:491537/52‑1 (MQ=255)
                                  ggCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCg  <  1:1171338/35‑1 (MQ=255)
                                                                    |
TCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCG  >  W3110S.gb/2003923‑2003991

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑