Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2014490	2015674	1185	24 [0]	[0] 225	intG–[fliF]	intG,fliE,[fliF]

TTAGATGTGACTTTATTTAATTGAACCGGCTGAGTTTTTAACGAAAGATCATTTAATGGAAACATT  >  W3110S.gb/2014424‑2014489                                                                  | ttAGATGTGACTTTATTTAATTGAACCGGCTGAGTTTTTAACGAAAGATCATTTAATGGAAACttt  <  1:1086940/66‑1 (MQ=255) ttAGATGTGACTTTATTTAATTGAACCGGCTGAGTTTTTAACGAAAGATCATTTAATGGAAACAtt  <  1:377747/66‑1 (MQ=255) ttAGATGTGACTTTATTTAATTGAACCGGCTGAGTTTTTAACGAAAGATCATTTAATGGAAACAtt  <  1:765633/66‑1 (MQ=255) ttAGATGTGACTTTATTTAATTGAACCGGCTGAGTTTTTAACGAAAGATCATTTAATGGAAACAtt  <  1:7589/66‑1 (MQ=255) ttAGATGTGACTTTATTTAATTGAACCGGCTGAGTTTTTAACGAAAGATCATTTAATGGAAACAtt  <  1:75358/66‑1 (MQ=255) ttAGATGTGACTTTATTTAATTGAACCGGCTGAGTTTTTAACGAAAGATCATTTAATGGAAACAtt  <  1:636879/66‑1 (MQ=255) ttAGATGTGACTTTATTTAATTGAACCGGCTGAGTTTTTAACGAAAGATCATTTAATGGAAACAtt  <  1:56410/66‑1 (MQ=255) ttAGATGTGACTTTATTTAATTGAACCGGCTGAGTTTTTAACGAAAGATCATTTAATGGAAACAtt  <  1:472941/66‑1 (MQ=255) ttAGATGTGACTTTATTTAATTGAACCGGCTGAGTTTTTAACGAAAGATCATTTAATGGAAACAtt  <  1:460872/66‑1 (MQ=255) ttAGATGTGACTTTATTTAATTGAACCGGCTGAGTTTTTAACGAAAGATCATTTAATGGAAACAtt  <  1:1060681/66‑1 (MQ=255) ttAGATGTGACTTTATTTAATTGAACCGGCTGAGTTTTTAACGAAAGATCATTTAATGGAAACAtt  <  1:26627/66‑1 (MQ=255) ttAGATGTGACTTTATTTAATTGAACCGGCTGAGTTTTTAACGAAAGATCATTTAATGGAAACAtt  <  1:253897/66‑1 (MQ=255) ttAGATGTGACTTTATTTAATTGAACCGGCTGAGTTTTTAACGAAAGATCATTTAATGGAAACAtt  <  1:205084/66‑1 (MQ=255) ttAGATGTGACTTTATTTAATTGAACCGGCTGAGTTTTTAACGAAAGATCATTTAATGGAAACAtt  <  1:1595721/66‑1 (MQ=255) ttAGATGTGACTTTATTTAATTGAACCGGCTGAGTTTTTAACGAAAGATCATTTAATGGAAACAtt  <  1:1558736/66‑1 (MQ=255) ttAGATGTGACTTTATTTAATTGAACCGGCTGAGTTTTTAACGAAAGATCATTTAATGGAAACAtt  <  1:1463651/66‑1 (MQ=255) ttAGATGTGACTTTATTTAATTGAACCGGCTGAGTTTTTAACGAAAGATCATTTAATGGAAACAtt  <  1:1269106/66‑1 (MQ=255) ttAGATGTGACTTTATTTAATTGAACCGGCTGAGTTTTTAACGAAAGATCATTTAATGGAAACAtt  <  1:1217289/66‑1 (MQ=255) ttAGATGTGACTTTATTTAATTGAACCGGCTGAGTTTTTAACGAAAGATCATTTAATGGAAACAtt  <  1:1167864/66‑1 (MQ=255) ttAGATGTGACTTTATTTAATTGAACCGGCTGAGTTTTTAACGAAAGATCATATAATGGAAACAtt  <  1:854740/66‑1 (MQ=255)  tAGATGTGACTTTATTTAATTGAACCGGCTGAGTTTATAACGAAAGATCATTTAATGGAAACAtt  <  1:734411/65‑1 (MQ=255)                              cTGAGTTTTTAACGAAAGATCATTTAATGGAAACAtt  <  1:308868/37‑1 (MQ=255)                              cTGAGTTTTTAACGAAAGATCATTTAATGGAAACAtt  <  1:711188/37‑1 (MQ=255)                               tGAGTTTTTAACGAAAGATCATTTAATGGAAACAtt  <  1:834659/36‑1 (MQ=255)                                                                  | TTAGATGTGACTTTATTTAATTGAACCGGCTGAGTTTTTAACGAAAGATCATTTAATGGAAACATT  >  W3110S.gb/2014424‑2014489

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑