Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2166517	2166585	69	81 [0]	[0] 79	baeR	DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with BaeS

GGAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTA  >  W3110S.gb/2166460‑2166516                                                         | tgAAGATGAACCGAAGCTGGGGCTGTTGCTCATTGATTATCTTCGTGCTGCGAGCTa  <  1:649096/56‑1 (MQ=39) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGTCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:1570559/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTTCGTGCTGCGAGCTa  <  1:74792/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:583398/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:679622/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:670385/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:662159/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:633930/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:600317/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:597762/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:594261/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:679637/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:55094/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:541701/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:531088/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:519459/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:512250/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:459869/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:40873/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:326053/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:837112/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:991742/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:983301/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:961657/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:900027/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:873535/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:870031/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:844185/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:841252/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:1045996/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:80213/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:801801/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:773886/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:772264/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:757841/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:738041/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:736059/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:709381/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:1230849/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:1384239/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:1340068/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:1056398/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:1307331/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:1282595/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:1278272/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:1272461/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:1271978/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:1245056/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:1399765/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:120585/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:1063083/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:1074061/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:1193919/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:1169865/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:115923/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:1093510/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:1092849/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:1603378/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:308467/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:256766/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:231850/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:220373/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:312795/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:206017/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:191252/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:191066/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:1568492/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:1532066/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:14708/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:1023058/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:1428021/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:141802/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:1417721/57‑1 (MQ=255) ggAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGGTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:1504229/57‑1 (MQ=255)  gAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:997605/56‑1 (MQ=255)  gAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:809395/56‑1 (MQ=255)  gAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:717626/56‑1 (MQ=255)  gAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:516422/56‑1 (MQ=255)   aaGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:835503/55‑1 (MQ=255)   aaGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:1432804/55‑1 (MQ=255)               aGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTACCTGCGTGCTGCGAGCTa  <  1:944533/43‑1 (MQ=255)                                                         | GGAAGATGAACCGAAGCTGGGGCAGTTGCTCATTGATTATCTGCGTGCTGCGAGCTA  >  W3110S.gb/2166460‑2166516

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑