Missing coverage evidence...
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CCTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTGCGC  >  W3110S.gb/2187271‑2187339                                                                     | ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGCCCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:1455622/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCCCCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:813044/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCCCCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:775635/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCTTTAGCACTgcgc  >  1:1204576/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:536512/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:181834/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:250643/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:255127/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:272889/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:294611/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:420189/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:451092/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:480606/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:530671/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:1509870/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:646370/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:731611/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:76986/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:819199/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:925305/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:966242/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:1364212/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:1024852/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:1126495/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:1197309/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:1251429/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:1264623/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:1292030/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:1297556/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:1313370/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:1359442/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:1539261/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:1375867/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:1398716/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:1409176/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:1413234/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:1419863/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:1474664/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:1493521/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTgcgc  >  1:1021306/1‑69 (MQ=255) ccTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTAATTAGCACTgcgc  >  1:292714/1‑69 (MQ=255)                                                                     | CCTCGCGGGTAAACAGCCAGTCCGGGCTTTGCTCATCATCCAGATGACCACCTTTCATTAGCACTGCGC  >  W3110S.gb/2187271‑2187339

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑