Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2201652	2201721	70	93 [0]	[0] 117	molR molR	DNA‑binding transcriptional regulator; ECK2108:JW2102+JW5915+JW5916:b4499 DNA‑binding transcriptional regulator, middle fragment; ECK2108:JW5915:b2116

ATGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCATTA  >  W3110S.gb/2201583‑2201651                                                                     | atagCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:594271/4‑69 (MQ=255) aTGGCTATATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:1496802/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCATCCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:1008569/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTATGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:965154/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:708552/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:71608/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:700273/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:685263/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:677952/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:668955/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:624258/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:617894/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:615015/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:584233/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:575752/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:570208/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:555127/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:55490/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:547198/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:506339/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:500365/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:480383/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:469700/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:447929/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:395517/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:841337/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:992628/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:975989/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:918977/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:900631/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:88086/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:875237/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:873335/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:871725/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:86672/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:843670/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:714456/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:810723/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:791701/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:786750/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:785848/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:768195/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:752150/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:741307/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:737734/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:736751/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:377415/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:1299871/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:1524793/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:1497769/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:1486127/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:1435013/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:1426421/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:1422181/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:1403388/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:1375086/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:1347350/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:1342717/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:1310393/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:1555233/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:1265150/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:1243069/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:1190489/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:1147986/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:1125628/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:1119696/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:1067071/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:1056595/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:1045230/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:1027097/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:196761/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:322361/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:322240/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:321957/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:314655/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:313995/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:307716/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:29904/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:287879/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:28739/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:247830/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:240884/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:392070/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:193477/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:175462/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:168339/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:1606306/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:1585098/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:1584337/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:1584106/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:1568150/1‑69 (MQ=255) aTGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:1566618/1‑69 (MQ=255) aTGCCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCatta  >  1:606382/1‑69 (MQ=255)                                                                     | ATGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACCTACCGGGCATTA  >  W3110S.gb/2201583‑2201651

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑