Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2209459	2209508	50	42 [0]	[0] 136	yehM	hypothetical protein

GCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAG  >  W3110S.gb/2209390‑2209458                                                                     | gCCTGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACACCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:576529/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTAGTGCTGCGTGCCACCCGCTTGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:26799/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATTACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCTAAg  <  1:1151552/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:472296/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:24992/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:307074/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:352515/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:365489/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:412534/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:444328/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:45563/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:461616/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:464550/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:229664/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:542939/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:587510/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:660372/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:755416/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:871153/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:874996/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:995763/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:137745/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:1119359/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:1154157/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:1166737/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:1176714/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:1201387/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:1268088/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:1274047/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:1366441/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:1374907/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:1006715/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:1392909/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:1404523/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:143602/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:145528/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:1462719/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:1465186/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:1589895/69‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:196107/69‑1 (MQ=255)        cTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:1465654/62‑1 (MQ=255)                               tGGATAACAGCTATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAg  <  1:867495/39‑1 (MQ=255)                                                                     | GCCAGGCCTTACTGCTGCGTGCCACCCGCATGGATAACAGCGATACCCTGTGGGATCACTTGTTCGAAG  >  W3110S.gb/2209390‑2209458

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑