Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2216623	2216843	221	35 [0]	[0] 148	yehU	predicted sensory kinase in two‑component system with YehT

GCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGC  >  W3110S.gb/2216574‑2216622                                                 | gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:356017/49‑1 (MQ=255) gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:980351/49‑1 (MQ=255) gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:939206/49‑1 (MQ=255) gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:929249/49‑1 (MQ=255) gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:771263/49‑1 (MQ=255) gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:770223/49‑1 (MQ=255) gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:62174/49‑1 (MQ=255) gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:600197/49‑1 (MQ=255) gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:581114/49‑1 (MQ=255) gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:573638/49‑1 (MQ=255) gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:539925/49‑1 (MQ=255) gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:529500/49‑1 (MQ=255) gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:441085/49‑1 (MQ=255) gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:413386/49‑1 (MQ=255) gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:402729/49‑1 (MQ=255) gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:1003113/49‑1 (MQ=255) gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:1205829/49‑1 (MQ=255) gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:1015317/49‑1 (MQ=255) gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:1019213/49‑1 (MQ=255) gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:1037616/49‑1 (MQ=255) gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:1095728/49‑1 (MQ=255) gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:1110157/49‑1 (MQ=255) gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:1128469/49‑1 (MQ=255) gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:117064/49‑1 (MQ=255) gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:1194832/49‑1 (MQ=255) gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:1592353/49‑1 (MQ=255) gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:1207064/49‑1 (MQ=255) gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:1226270/49‑1 (MQ=255) gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:1318477/49‑1 (MQ=255) gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:1348454/49‑1 (MQ=255) gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:1458222/49‑1 (MQ=255) gCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGAGGAATAGc  <  1:404768/49‑1 (MQ=255)  cAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:1216039/48‑1 (MQ=255)  cAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:891828/48‑1 (MQ=255)               ggCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc  <  1:501540/35‑1 (MQ=255)                                                 | GCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGC  >  W3110S.gb/2216574‑2216622

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑