Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2234161	2234178	18	66 [1]	[0] 55	yohJ	conserved inner membrane protein

CCTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGATT  >  W3110S.gb/2234092‑2234161                                                                     |  ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCTGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:1292689/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:647824/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:234548/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:100128/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:318825/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:330401/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:332872/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:356600/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:413459/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:426473/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:451468/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:515/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:556400/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:559213/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:587214/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:644914/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:246748/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:7030/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:7688/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:787861/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:80995/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:833057/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:835449/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:897304/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:900139/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:909834/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:930602/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:9310/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:939863/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:945878/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:956823/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:990082/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:1149905/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:165613/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:1264531/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:1259508/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:1245228/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:1182445/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:1169729/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:1160976/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:1152595/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:1264981/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:1144832/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:1135393/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:1124141/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:1036430/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:1034597/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:1033587/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:1008006/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:1352911/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:1596088/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:1518765/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:1507148/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:1499197/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:1469374/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:1274518/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:1325434/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:1319222/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:1314797/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:1292241/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:1288539/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:1287965/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGC‑AAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAtt  >  1:355829/1‑69 (MQ=255) ccTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGACAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:4790/1‑69 (MQ=255) ccTGTTAGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:3274/1‑69 (MQ=255) acTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGAt   >  1:911446/2‑69 (MQ=255)                                                                     |  CCTGTTTGTCCTGCTGGCCTTGCAAATTCTTCCGGCAAAATGGGTCAATCCGGGGTGCTACGTACTGATT  >  W3110S.gb/2234092‑2234161

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑