Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2263991	2264139	149	74 [0]	[0] 157	fruA	fused fructose‑specific PTS enzyme IIB'BC components

TCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACCAAAAGCAA  >  W3110S.gb/2263937‑2263990                                                      | tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:506266/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:650606/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:626559/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:615010/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:573882/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:556454/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:554693/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:544115/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:511071/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:663529/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:499833/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:48340/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:477760/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:421547/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:402784/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:38249/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:353418/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:1060157/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:790349/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:977417/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:945266/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:937697/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:934135/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:928764/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:906411/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:858490/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:84542/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:346850/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:782451/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:765749/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:751391/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:733806/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:717836/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:714605/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:691678/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:670627/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:1227673/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:340196/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:1350953/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:1349748/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:1349413/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:1348662/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:1320800/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:1284743/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:1276198/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:1242046/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:1354800/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:1215417/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:1158391/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:1145517/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:1122327/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:1102752/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:1091075/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:106929/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:1063856/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:1375727/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:310793/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:257598/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:215881/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:207506/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:20683/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:157111/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:1567431/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:1558967/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:1554928/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:1514591/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:1509464/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:146241/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:139901/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:1356762/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCGCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:786883/1‑54 (MQ=255) tCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCGCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:523430/1‑54 (MQ=255) tCAGCGACGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:205444/1‑54 (MQ=255) tCAGCGACGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACcaaaagcaa  >  1:207626/1‑54 (MQ=255)                                                      | TCAGCGCCGCAGCCAACGTACCCGGCTCTTTAAACGCTTCGATACCAAAAGCAA  >  W3110S.gb/2263937‑2263990

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑