Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2293743	2293812	70	52 [0]	[0] 52	insH/narP	IS5 transposase and trans‑activator/DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with NarQ or NarX

CCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCA  >  W3110S.gb/2293702‑2293742                                         | tcAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:24419/40‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:647807/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:362812/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:37572/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:417689/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:431035/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:433274/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:444412/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:456023/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:466596/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:527065/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:573539/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:605227/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:355601/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:655070/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:65654/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:698058/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:700845/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:707141/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:767113/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:806597/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:863711/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:867355/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:9333/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:944834/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:986290/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:1498202/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:11478/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:1152428/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:1169174/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:1222618/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:1232629/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:1240149/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:130253/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:132885/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:1380238/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:1397882/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:1419222/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:1064054/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:153900/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:1544408/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:1544851/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:227839/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:270316/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:323878/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:32563/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:332703/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:335786/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:348840/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:350481/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGTTGTACTTTTCACTACATGTCca  <  1:168128/41‑1 (MQ=255) ccAAAGCGAACGACAAGGGTGTAGTTTTCACTACATGTCca  <  1:91206/41‑1 (MQ=255)                                         | CCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTACATGTCCA  >  W3110S.gb/2293702‑2293742

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑