Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2317218	2317254	37	31 [0]	[0] 179	rcsD	phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC

GAAGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTG  >  W3110S.gb/2317149‑2317217                                                                     | gAAGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTg  <  1:1017613/69‑1 (MQ=255) gAAGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTg  <  1:932692/69‑1 (MQ=255) gAAGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTg  <  1:9080/69‑1 (MQ=255) gAAGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTg  <  1:890549/69‑1 (MQ=255) gAAGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTg  <  1:851045/69‑1 (MQ=255) gAAGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTg  <  1:834059/69‑1 (MQ=255) gAAGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTg  <  1:819029/69‑1 (MQ=255) gAAGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTg  <  1:351537/69‑1 (MQ=255) gAAGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTg  <  1:267465/69‑1 (MQ=255) gAAGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTg  <  1:1564086/69‑1 (MQ=255) gAAGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTg  <  1:1560996/69‑1 (MQ=255) gAAGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTg  <  1:1560824/69‑1 (MQ=255) gAAGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTg  <  1:1426046/69‑1 (MQ=255) gAAGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTg  <  1:1010733/69‑1 (MQ=255) gAAGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTg  <  1:1090888/69‑1 (MQ=255) gAAGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTg  <  1:1149469/69‑1 (MQ=255) gAAGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTg  <  1:1159081/69‑1 (MQ=255) gAAGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTg  <  1:1225824/69‑1 (MQ=255) gAAGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTg  <  1:1229595/69‑1 (MQ=255) gAAGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTg  <  1:1229964/69‑1 (MQ=255) gAAGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTg  <  1:1296257/69‑1 (MQ=255)  aaGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTg  <  1:334206/68‑1 (MQ=255)  aaGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTg  <  1:344755/68‑1 (MQ=255)  aaGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTg  <  1:271911/68‑1 (MQ=255)  aaGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTg  <  1:1224612/68‑1 (MQ=255)  aaGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTg  <  1:266877/68‑1 (MQ=255)  aaGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTg  <  1:962091/68‑1 (MQ=255)  aaGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCAACTTATCTg  <  1:855477/68‑1 (MQ=255)   aGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTg  <  1:65689/67‑1 (MQ=255)   aGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTg  <  1:1493171/67‑1 (MQ=255)                       aCGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTg  <  1:1289459/47‑1 (MQ=255)                                                                     | GAAGCGTTAATCTTTGGCTCTCACGACAACTCAACGCTTGAGATGACTCAGCGGATGTCCACTTATCTG  >  W3110S.gb/2317149‑2317217

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑