Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2318957	2319073	117	66 [0]	[0] 18	rcsD	phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC

TACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCA  >  W3110S.gb/2318890‑2318956                                                                   | tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:552282/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:742697/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:660430/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:642946/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:63118/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:616783/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:599302/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:584478/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:572771/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:74553/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:512819/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:509853/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:484403/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:466506/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:442425/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:43556/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:415753/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:412048/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:751394/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:751854/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:773473/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:840497/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:858260/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:86170/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:895375/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:904079/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:906369/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:908136/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:90893/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:916953/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:918956/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:949322/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:963239/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:1329607/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:1477145/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:1476570/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:1463445/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:1438702/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:1433218/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:1431804/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:1411710/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:1393847/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:1499294/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:1277546/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:1236887/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:1233546/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:1201156/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:1194951/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:1184012/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:1151935/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:1001664/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:1500148/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:1501114/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:1516998/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:1524705/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:1568111/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:159370/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:1604130/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:168708/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:181922/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:235554/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:269884/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:285114/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:311625/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:315176/1‑67 (MQ=255) tACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCa  >  1:374788/1‑67 (MQ=255)                                                                   | TACTGGATGATGTCTGCGTAATGGTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCA  >  W3110S.gb/2318890‑2318956

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑