Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	2322526	2322933	408	41 [0]	[0] 161	rcsC	hybrid sensory kinase in two‑component regulatory system with RcsB and YojN

GCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCT  >  W3110S.gb/2322458‑2322525                                                                    | gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:619902/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:1450997/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:1561529/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:194116/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:246459/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:3396/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:429427/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:438483/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:453813/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:548949/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:1479243/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:715434/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:752874/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:781124/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:795846/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:804308/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:883546/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:905770/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:912229/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:1229940/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:1002622/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:1056336/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:1064785/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:1092875/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:111670/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:117015/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:1185492/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:1216904/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:143638/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:1235833/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:1252816/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:126835/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:1270034/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:1334984/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:1380788/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:1413871/68‑1 (MQ=255) gCGGGTACTGACCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:1146104/68‑1 (MQ=255)  cGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:582237/67‑1 (MQ=255)  cGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:322332/67‑1 (MQ=255)     gTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:1000748/64‑1 (MQ=255)                    cAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCt  <  1:468931/49‑1 (MQ=255)                                                                    | GCGGGTACTGAGCGCCGTACAACGGAATACGCACGGTAAACTGGCTGCCCATTCCCGGTTCTGAATCT  >  W3110S.gb/2322458‑2322525

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑