Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2325195	2326352	1158	39 [0]	[0] 23	atoS	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with AtoC

GCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCC  >  W3110S.gb/2325126‑2325194                                                                     | gCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGGAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:308630/69‑1 (MQ=255) gCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:1170458/69‑1 (MQ=255) gCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:923633/69‑1 (MQ=255) gCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:845291/69‑1 (MQ=255) gCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:738292/69‑1 (MQ=255) gCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:728516/69‑1 (MQ=255) gCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:716260/69‑1 (MQ=255) gCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:660122/69‑1 (MQ=255) gCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:658379/69‑1 (MQ=255) gCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:651235/69‑1 (MQ=255) gCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:569003/69‑1 (MQ=255) gCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:562064/69‑1 (MQ=255) gCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:489410/69‑1 (MQ=255) gCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:462660/69‑1 (MQ=255) gCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:416338/69‑1 (MQ=255) gCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:31307/69‑1 (MQ=255) gCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:1589886/69‑1 (MQ=255) gCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:118359/69‑1 (MQ=255) gCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:1296865/69‑1 (MQ=255) gCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:1297076/69‑1 (MQ=255) gCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:1339964/69‑1 (MQ=255) gCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:1477918/69‑1 (MQ=255) gCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:1503559/69‑1 (MQ=255) gCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:1529107/69‑1 (MQ=255) gCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:1014978/69‑1 (MQ=255) gCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:199051/69‑1 (MQ=255) gCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:284827/69‑1 (MQ=255) gCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:254460/69‑1 (MQ=255) gCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:268545/69‑1 (MQ=255) gCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATAATTTGAATTCAATGCTccc  <  1:288825/69‑1 (MQ=255)  cGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:1590470/68‑1 (MQ=255)  cGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:514506/68‑1 (MQ=255)  cGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:1590514/68‑1 (MQ=255)  cGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:463157/68‑1 (MQ=255)  cGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:821094/68‑1 (MQ=255)  cGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:840530/68‑1 (MQ=255)      cAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:967286/64‑1 (MQ=255)               cTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:590087/55‑1 (MQ=255)                    gTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTccc  <  1:199118/50‑1 (MQ=255)                                                                     | GCGTACAAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCC  >  W3110S.gb/2325126‑2325194

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑