Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2458061	2458460	400	90 [0]	[0] 65	yfcT	predicted outer membrane export usher protein

GAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCG  >  W3110S.gb/2458000‑2458060                                                             | gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:477844/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:657246/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:64649/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:646149/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:624879/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:608848/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:604753/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:574306/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:558670/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:557147/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:518995/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:495667/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:68961/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:443525/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:427931/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:410419/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:376234/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:358434/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:352816/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:349697/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:348729/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:327206/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:307836/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:826235/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:985929/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:976505/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:938130/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:916072/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:9049/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:86718/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:854780/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:851145/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:83991/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:834153/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:26498/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:805469/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:801844/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:787407/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:772866/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:753825/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:736204/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:723892/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:711257/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:703857/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:699464/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:115448/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:139788/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:1358656/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:1347329/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:1333453/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:1308152/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:1303254/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:1274984/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:123967/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:1216916/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:118353/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:1158580/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:1401850/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:115342/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:1152481/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:1144825/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:1131533/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:112170/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:1107160/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:1086343/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:1076482/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:1076083/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:1035272/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:1587755/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:251520/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:248503/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:221411/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:219071/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:183295/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:166652/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:159735/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:1594619/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:1594405/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:1591397/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:100693/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:1587184/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:1563464/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:1540872/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:1539556/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:1524648/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:1495407/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:1486724/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:1447115/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:1430981/1‑61 (MQ=255) gAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCg  >  1:1406428/1‑61 (MQ=255)                                                             | GAACACACTCATATGTTCGCCAGGTTTCACCCCAGCCAGATAGACACTACCGTCATCATCG  >  W3110S.gb/2458000‑2458060

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑