Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	2523282	2523800	519	39 [0]	[0] 63	alaX–alaW	alaX,alaW

TTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAG  >  W3110S.gb/2523244‑2523281                                      | ttGATATTTTTTATCAGGTTATGTTCCACAAACATGAg  <  1:419547/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:699981/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:482880/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:49852/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:50543/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:553628/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:561645/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:65376/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:667014/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:696141/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:405550/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:711747/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:742331/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:760051/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:816915/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:848091/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:868193/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:871304/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:874555/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:961705/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:1494944/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:1105354/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:1140412/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:115155/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:1163386/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:1221688/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:1249598/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:1326320/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:1468803/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:1490557/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:1065334/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:1524533/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:200331/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:210096/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:244298/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:312027/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:31244/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:322491/38‑1 (MQ=255) ttGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAg  <  1:346506/38‑1 (MQ=255)                                      | TTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGAG  >  W3110S.gb/2523244‑2523281

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑