Missing coverage evidence...
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CACCCACCACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAG  >  W3110S.gb/2526686‑2526725                                        | cacccaccACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAg  >  1:301084/1‑40 (MQ=255) cacccaccACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAg  >  1:982882/1‑40 (MQ=255) cacccaccACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAg  >  1:936929/1‑40 (MQ=255) cacccaccACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAg  >  1:810368/1‑40 (MQ=255) cacccaccACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAg  >  1:749865/1‑40 (MQ=255) cacccaccACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAg  >  1:697902/1‑40 (MQ=255) cacccaccACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAg  >  1:633745/1‑40 (MQ=255) cacccaccACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAg  >  1:617768/1‑40 (MQ=255) cacccaccACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAg  >  1:594222/1‑40 (MQ=255) cacccaccACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAg  >  1:57133/1‑40 (MQ=255) cacccaccACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAg  >  1:529100/1‑40 (MQ=255) cacccaccACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAg  >  1:463137/1‑40 (MQ=255) cacccaccACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAg  >  1:386154/1‑40 (MQ=255) cacccaccACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAg  >  1:383591/1‑40 (MQ=255) cacccaccACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAg  >  1:1026440/1‑40 (MQ=255) cacccaccACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAg  >  1:172650/1‑40 (MQ=255) cacccaccACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAg  >  1:1591976/1‑40 (MQ=255) cacccaccACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAg  >  1:1541381/1‑40 (MQ=255) cacccaccACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAg  >  1:1496853/1‑40 (MQ=255) cacccaccACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAg  >  1:1486923/1‑40 (MQ=255) cacccaccACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAg  >  1:1484249/1‑40 (MQ=255) cacccaccACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAg  >  1:1455363/1‑40 (MQ=255) cacccaccACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAg  >  1:1328501/1‑40 (MQ=255) cacccaccACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAg  >  1:1286014/1‑40 (MQ=255) cacccaccACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAg  >  1:1237505/1‑40 (MQ=255) cacccaccACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAg  >  1:1175656/1‑40 (MQ=255) cacccaccACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAg  >  1:1173573/1‑40 (MQ=255) cacccaccACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAg  >  1:1056779/1‑40 (MQ=255)                                        | CACCCACCACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAG  >  W3110S.gb/2526686‑2526725

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑