Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2539073	2539182	110	94 [0]	[0] 78	cysK/ptsH	cysteine synthase A, O‑acetylserine sulfhydrolase A subunit/phosphohistidinoprotein‑hexose phosphotransferase component of PTS system (Hpr)

ATGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAACA  >  W3110S.gb/2539005‑2539072                                                                    | aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCTTAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:858047/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAGTGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:850008/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:50985/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:732574/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:67751/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:673747/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:660115/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:613686/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:595398/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:563251/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:545194/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:526500/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:525197/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:752590/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:500726/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:493275/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:489785/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:482516/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:459446/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:44615/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:444057/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:441611/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:431890/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:420223/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:1015040/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:875448/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:96711/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:964089/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:956025/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:95341/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:92048/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:915236/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:909761/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:896178/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:893682/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:887858/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:749437/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:873190/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:856151/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:825222/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:817272/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:816707/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:79917/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:793707/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:759766/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:754412/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:394118/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:123175/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:388688/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:1473199/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:1472629/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:1471805/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:1425415/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:1399153/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:1393910/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:1357524/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:135087/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:1261316/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:1247701/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:147837/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:1195276/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:1159619/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:1105282/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:1101635/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:1099973/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:1081746/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:1078879/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:1065957/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:1063058/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:10274/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:229476/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:385523/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:377186/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:35229/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:337597/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:316133/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:309367/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:289472/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:284550/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:27433/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:1479739/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:21755/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:186669/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:178970/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:166815/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:1588555/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:1557445/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:1555498/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:1542215/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:1496450/68‑1 (MQ=255) aTGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:1481838/68‑1 (MQ=255) aTGAATTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:89696/68‑1 (MQ=255)    aTTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:1584367/65‑1 (MQ=255)        ggTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAaca  <  1:1102326/61‑1 (MQ=255)                                                                    | ATGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGGCATAATGTTTAATGACGTACGAAACGTCAGCGGTCAACA  >  W3110S.gb/2539005‑2539072

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑