Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2651021	2651484	464	53 [0]	[0] 113	[sseA]	[sseA]

ATGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAG  >  W3110S.gb/2650961‑2651020                                                            | aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTTATTCAg  <  1:207438/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:580081/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:152068/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:156768/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:251965/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:887770/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:283855/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:881611/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:413280/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:478699/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:511702/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:1515043/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:587375/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:61809/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:665989/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:666148/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:71499/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:775951/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:879225/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:797865/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:855623/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:878855/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:132958/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:1052419/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:1085521/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:1114628/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:932877/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:1239101/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:927046/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:1253837/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:1275052/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:1298255/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:1319855/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:132086/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:1513907/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:1367194/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:1396409/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:1406992/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:1412444/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:1426600/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:1442432/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:1445618/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:1447333/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:917105/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTTAGCAAAGTCGAATAATTATTATGCGTTAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:248238/60‑1 (MQ=255) aTGGCCCGTAAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:985852/60‑1 (MQ=255)  tGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:1246266/59‑1 (MQ=255)  tGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:1203935/59‑1 (MQ=255)   ggCCAGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:1466561/58‑1 (MQ=255)     cccGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTATTTCAg  <  1:786155/56‑1 (MQ=255)         ttAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:353054/52‑1 (MQ=255)                   cGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAg  <  1:1066766/42‑1 (MQ=255)                     aataatTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATTTAATTCAg  <  1:272016/40‑1 (MQ=255)                                                            | ATGGCCCGTTAGCAACGTCGAATAATTATTATGCGTGAGAATTTACGTTATGTAATTCAG  >  W3110S.gb/2650961‑2651020

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑