Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2751309	2751332	24	71 [0]	[0] 23	recN	recombination and repair protein

CGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCAC  >  W3110S.gb/2751242‑2751308                                                                   | cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:383784/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:489765/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:47097/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:445177/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:429454/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:426422/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:4195/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:416791/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:387417/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:505441/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:364120/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:291122/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:243890/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:232042/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:19233/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:190780/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1578039/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:172524/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:529900/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:536103/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:556312/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:626273/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:686588/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:720043/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:773061/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:789807/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:792875/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:819647/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:873211/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:874549/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:89290/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:906916/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:927286/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1223000/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1567001/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1354566/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1344741/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1318935/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1317565/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1306114/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1269334/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1233454/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1356766/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1181434/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1145240/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1097909/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1050416/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1024875/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1019891/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1010827/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1009106/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1495386/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1548892/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1543346/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:151403/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1513855/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1497330/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1403422/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1481802/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1470310/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1467920/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1428645/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1416537/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1414973/67‑1 (MQ=255) cGGCGTACTTGATATGCTGCAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:26751/67‑1 (MQ=255)  ggCGTACTTGATATGCTGGAAGCAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1504089/66‑1 (MQ=255)   gCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:843048/65‑1 (MQ=255)                   ggAAGAAGCTACCATCCAGATTACTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:403935/49‑1 (MQ=255)                       gaagCTACCACCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:400760/45‑1 (MQ=255)                              ccATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1316507/38‑1 (MQ=255)                              ccATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCac  <  1:1004781/38‑1 (MQ=255)                                                                   | CGGCGTACTTGATATGCTGGAAGAAGCTACCATCCAGATTGCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCAC  >  W3110S.gb/2751242‑2751308

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑