Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2761343	2761827	485	53 [0]	[0] 236	yfjK	conserved hypothetical protein

GCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATG  >  W3110S.gb/2761274‑2761342                                                                     | tcGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:1360650/68‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:470176/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:1077343/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:229622/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:239622/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:253930/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:294742/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:305919/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:309887/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:371503/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:382854/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:413169/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:420879/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:227076/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:479308/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:504238/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:506490/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:57687/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:586228/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:605866/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:634236/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:715202/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:73220/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:777476/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:816779/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:826796/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:1327041/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:1106628/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:1143692/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:1172134/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:1173803/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:120478/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:1212538/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:1223371/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:1232415/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:1235076/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:1257270/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:127969/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:194330/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:1331125/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:1352811/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:1406853/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:1413593/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:1471156/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:1486801/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:1519042/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:1535303/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:1536843/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:1555424/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:1590328/69‑1 (MQ=255) gCGTCGACACATGCGTGCCCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:499259/69‑1 (MQ=255)                  agcgATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCTTCATTCGCTTTGATg  <  1:368896/51‑1 (MQ=255)                          cccccAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATg  <  1:802324/44‑1 (MQ=255)                                                                     | GCGTCGACACATGCGTGCGCGATTTCCCCCAGCGCTTTGAGCTTGGCTTTGTCGTCATTCGCTTTGATG  >  W3110S.gb/2761274‑2761342

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑