Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2776910	2777957	1048	82 [0]	[0] 152	ypjA	adhesin‑like autotransporter

GGATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGC  >  W3110S.gb/2776841‑2776909                                                                     | ggATTCCACACTGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:858125/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATTCCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:828637/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:422316/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:621530/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:563765/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:549461/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:534350/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:532265/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:525068/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:513617/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:497182/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:469886/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:438774/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:653899/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:387335/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:356475/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:343653/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:318815/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:1021962/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:289645/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:280221/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:81592/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:999315/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:994350/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:977264/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:962917/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:943249/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:904900/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:889867/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:821471/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:630023/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:772351/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:733484/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:731786/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:694460/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:692208/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:674731/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:670860/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:301420/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:116427/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:1366595/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:276113/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:1312509/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:1299488/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:1249796/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:122174/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:1217563/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:1181404/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:1171021/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:1361476/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:1155396/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:1147523/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:1126808/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:1124896/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:1100237/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:1096130/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:1064473/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:1063649/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:102493/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:140324/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:23487/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:183630/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:178995/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:169238/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:1573913/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:1570031/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:1555960/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:1551046/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:1547745/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:1492981/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:1454610/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:1433868/69‑1 (MQ=255) ggATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:1430807/69‑1 (MQ=255)  gATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:1209349/68‑1 (MQ=255)  gATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:475081/68‑1 (MQ=255)  gATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:703461/68‑1 (MQ=255)  gATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:356268/68‑1 (MQ=255)  gATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:1387494/68‑1 (MQ=255)  gATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:266551/68‑1 (MQ=255)               cACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:410966/55‑1 (MQ=255)                aCTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:1082532/54‑1 (MQ=255)                 cTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGc  <  1:647271/53‑1 (MQ=255)                                                                     | GGATTCCACACCGGCACTATGGCTATACCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGC  >  W3110S.gb/2776841‑2776909

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑