Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2786397 2786498 102 115 [0] [0] 241 yqaC ECK2651:JW5426:b2657; conserved hypothetical protein

Only 100 of 115 total aligned reads displayed.

CGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGA  >  W3110S.gb/2786328‑2786396
                                                                    |
cGAAAATCTGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:628348/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGATGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:594334/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGTTGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1368702/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:424262/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:553896/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:534760/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:532855/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:530856/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:505992/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:490687/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:477254/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:469662/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:452701/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:268972/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:410260/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:398064/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:393273/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:358002/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:350305/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:33767/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:32973/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:307424/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:303818/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1005278/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:28059/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:766845/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:986676/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:978918/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:975999/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:943860/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:885846/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:840046/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:809835/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:805749/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:781581/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:780604/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:775373/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:587481/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:730083/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:717444/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:717326/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:712256/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:696854/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:691233/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:681092/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:668682/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:648912/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:636019/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1089565/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1217292/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1216106/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1196772/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1192721/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1172569/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1150712/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1136696/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:113645/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1134281/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1099923/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1096302/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:257256/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1081957/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1081552/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1069955/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:10687/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1054446/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1038264/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1029337/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1019109/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1015896/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1007445/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1474811/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:26675/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:213271/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:208958/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:185753/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:174839/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:166888/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1589300/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1588675/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1555413/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1539843/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1525959/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1219365/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1438053/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1409582/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1397408/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1365519/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1259967/69‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1231663/69‑1 (MQ=255)
 gAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:118819/68‑1 (MQ=255)
     atatGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAATACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:654563/64‑1 (MQ=255)
        tGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:51434/61‑1 (MQ=255)
          gCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCCAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1466639/59‑1 (MQ=255)
            gTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:966497/57‑1 (MQ=255)
                    tttACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:964619/49‑1 (MQ=255)
                    tttACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1210499/49‑1 (MQ=255)
                      tACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1556485/47‑1 (MQ=255)
                         gTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:1313736/44‑1 (MQ=255)
                           tATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGa  <  1:652624/42‑1 (MQ=255)
                                                                    |
CGAAAATATGGCGTACGAGGTTTACGTTATGATGCGGCAAAACACTCAAAACATGAACAAATAGAAAGA  >  W3110S.gb/2786328‑2786396

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: