Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2811185 2811200 16 152 [0] [0] 51 emrA multidrug efflux system

Only 100 of 152 total aligned reads displayed.

TCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCA  >  W3110S.gb/2811116‑2811184
                                                                    |
tCAATAGCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:208108/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGTAAATAAGGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:437494/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:41492/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:600186/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:585388/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:584275/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:570210/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:563782/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:534683/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:534670/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:512932/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:504109/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:486134/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:462037/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:630627/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:412107/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:391511/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:384830/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:35470/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:347006/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:336629/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:332488/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:308995/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:304679/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:286857/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:76305/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:975933/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:940197/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:91201/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:87139/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:869115/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:847325/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:832976/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:803613/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:795206/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:788414/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:777959/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:766023/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:283988/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:756495/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:747979/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:734533/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:724752/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:712149/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:710403/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:693918/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:681838/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:640634/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:635900/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:633425/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1180124/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:102182/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1339439/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1324927/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1322245/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1279941/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1275828/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1260691/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1259476/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:124676/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1220968/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1206764/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1184277/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1356407/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1156601/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1154037/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1142914/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1138218/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:112604/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1108929/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1063968/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1062954/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1053433/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1040840/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:103121/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:136511/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:278164/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:240517/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:209522/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:205256/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:200715/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:165998/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1587913/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1587793/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1575961/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:155919/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1528583/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1524049/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1459774/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1448986/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1422183/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1414641/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1405519/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1399169/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1379909/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1377071/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:13705/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1358557/1‑69 (MQ=255)
tCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCAGGTAGCGGTAAGCa  >  1:1264028/1‑69 (MQ=255)
acAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGAACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTACGGTAGCGCTAAGCa  >  1:439963/2‑69 (MQ=38)
                                                                    |
TCAATACCACTAACCGTGACGGTCAGGTACTGGCAAATAAAGTACGTTCCACTCCGGTAGCGGTAAGCA  >  W3110S.gb/2811116‑2811184

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑