Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2824304	2824422	119	96 [0]	[0] 47	mltB/srlA	membrane‑bound lytic murein transglycosylase B/glucitol/sorbitol‑specific enzyme IIC component of PTS

TTTAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGT  >  W3110S.gb/2824243‑2824303                                                             | tttGACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1155094/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTTAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1068182/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCGCGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:721569/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCAGGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1466856/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:486868/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:627134/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:621507/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:613633/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:611857/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:583863/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:562881/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:561180/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:550851/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:548890/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:523306/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:495524/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:656288/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:462010/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:4616/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:44732/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:436624/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:428826/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:389897/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:375268/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:369421/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:345820/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:343782/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:783853/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:984012/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:898946/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:894262/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:850500/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:847673/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:841177/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:822885/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:803876/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:800238/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:796273/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:789254/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:642980/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:782400/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:757691/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:723802/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:720770/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:715991/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:71010/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:688769/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:662990/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:657697/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:311709/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1155254/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:335616/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1330299/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1316680/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1316411/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1309201/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1305674/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1287227/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1266466/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1202295/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1194225/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1159557/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1353983/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1153845/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:115314/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1127340/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1116115/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1096796/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:105774/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1044430/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1044395/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1036231/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1034279/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1537802/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1021555/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:295274/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:258352/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:240346/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:210026/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:198893/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:173348/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:164051/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1598844/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1590468/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1540654/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1366943/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1536048/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1525645/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1494281/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1491673/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1488137/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1466814/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1460588/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCAGCACAAGGAAGCGGt  >  1:1404580/1‑61 (MQ=255) tttAACAGATACAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGCAAGCGGt  >  1:1496609/1‑61 (MQ=255) ttaaaCAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGCAAGCGGt  >  1:1166285/4‑61 (MQ=255)                                                             | TTTAACAGATTCAACCAGGGGCAAGTATGGTAAAGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGT  >  W3110S.gb/2824243‑2824303

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑