Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2912366 2912840 475 85 [0] [0] 45 rumA 23S rRNA (uracil‑5)‑methyltransferase

CCGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAACGC  >  W3110S.gb/2912298‑2912365
                                                                   |
ccGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1115319/68‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:335478/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:517435/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:504655/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:495138/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:474231/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:453969/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:435368/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:428584/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:422861/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:389690/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:360010/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:525485/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:332493/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:328750/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:312704/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:232557/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:230954/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:203825/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:195766/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:19056/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:659732/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:991568/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:951330/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:877328/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:85148/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:784241/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:783656/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:748685/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:701182/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:691054/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1045099/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:657047/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:652153/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:644398/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:618197/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:616566/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:615643/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:614711/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:585423/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1160519/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:138055/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1354936/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1327253/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1295560/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1276642/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1253010/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1243563/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1207610/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1168670/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1167475/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1601453/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1148987/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1138733/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1104688/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1095915/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1084757/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1077950/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1062600/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1048807/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1005258/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1385409/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1386295/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1395659/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1402198/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:183561/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1403183/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:158348/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1451764/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:155703/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1464352/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1468980/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1524693/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1552080/67‑1 (MQ=255)
 cGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1550546/67‑1 (MQ=255)
  gCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:992080/66‑1 (MQ=255)
  gCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:243406/66‑1 (MQ=255)
  gCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:284135/66‑1 (MQ=255)
  gCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:311791/66‑1 (MQ=255)
  gCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1452845/66‑1 (MQ=255)
  gCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1451343/66‑1 (MQ=255)
  gCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1266281/66‑1 (MQ=255)
    aaCCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATATAAcgc  <  1:469789/64‑1 (MQ=255)
                     ttAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:1073031/47‑1 (MQ=255)
                             cAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAAcgc  <  1:869628/39‑1 (MQ=255)
                                                                   |
CCGCAACCATCGTCCTCTCCTTTAGGGACCAGACCTGCCGAAATCGGCAAATCGCAACTATTTAACGC  >  W3110S.gb/2912298‑2912365

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: