Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2978546	2978652	107	32 [0]	[0] 28	[lysR]–[ygeA]	[lysR],[ygeA]

CGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCATTT  >  W3110S.gb/2978480‑2978545                                                                  | cGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCAttt  <  1:1579503/66‑1 (MQ=255) cGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCAttt  <  1:929074/66‑1 (MQ=255) cGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCAttt  <  1:828443/66‑1 (MQ=255) cGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCAttt  <  1:760946/66‑1 (MQ=255) cGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCAttt  <  1:57357/66‑1 (MQ=255) cGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCAttt  <  1:529906/66‑1 (MQ=255) cGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCAttt  <  1:529397/66‑1 (MQ=255) cGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCAttt  <  1:527984/66‑1 (MQ=255) cGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCAttt  <  1:521092/66‑1 (MQ=255) cGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCAttt  <  1:392143/66‑1 (MQ=255) cGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCAttt  <  1:233321/66‑1 (MQ=255) cGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCAttt  <  1:225010/66‑1 (MQ=255) cGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCAttt  <  1:196311/66‑1 (MQ=255) cGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCAttt  <  1:1033075/66‑1 (MQ=255) cGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCAttt  <  1:1362949/66‑1 (MQ=255) cGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCAttt  <  1:111818/66‑1 (MQ=255) cGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCAttt  <  1:1126403/66‑1 (MQ=255) cGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCAttt  <  1:1130969/66‑1 (MQ=255) cGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCAttt  <  1:1352207/66‑1 (MQ=255) cGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCAttt  <  1:1550747/66‑1 (MQ=255) cGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCAttt  <  1:139403/66‑1 (MQ=255) cGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCAttt  <  1:1405940/66‑1 (MQ=255) cGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCAttt  <  1:1407515/66‑1 (MQ=255) cGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCAttt  <  1:1443784/66‑1 (MQ=255) cGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCAttt  <  1:1527321/66‑1 (MQ=255) cGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCAttt  <  1:154204/66‑1 (MQ=255) cGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGATTCAGGCGTTTAGTGGGCAttt  <  1:642549/66‑1 (MQ=255) cGTCAGACTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGTCAttt  <  1:1577058/66‑1 (MQ=255)  gTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCAttt  <  1:692548/65‑1 (MQ=255)  gTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCAttt  <  1:878082/65‑1 (MQ=255)                  cccTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCAttt  <  1:1315870/49‑1 (MQ=255)                             ccGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCAttt  <  1:1507033/38‑1 (MQ=255)                                                                  | CGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGGCATTT  >  W3110S.gb/2978480‑2978545

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑