Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2997092	2997176	85	28 [0]	[0] 95	ygeQ	hypothetical protein

ATCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCATATA  >  W3110S.gb/2997023‑2997091                                                                     | ctCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCAtata  <  1:452930/68‑1 (MQ=255) aTCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCAtata  <  1:406962/69‑1 (MQ=255) aTCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCAtata  <  1:968350/69‑1 (MQ=255) aTCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCAtata  <  1:915720/69‑1 (MQ=255) aTCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCAtata  <  1:784499/69‑1 (MQ=255) aTCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCAtata  <  1:717026/69‑1 (MQ=255) aTCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCAtata  <  1:632229/69‑1 (MQ=255) aTCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCAtata  <  1:62958/69‑1 (MQ=255) aTCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCAtata  <  1:598676/69‑1 (MQ=255) aTCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCAtata  <  1:537214/69‑1 (MQ=255) aTCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCAtata  <  1:459892/69‑1 (MQ=255) aTCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCAtata  <  1:1077094/69‑1 (MQ=255) aTCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCAtata  <  1:299703/69‑1 (MQ=255) aTCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCAtata  <  1:1576676/69‑1 (MQ=255) aTCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCAtata  <  1:1525812/69‑1 (MQ=255) aTCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCAtata  <  1:1464442/69‑1 (MQ=255) aTCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCAtata  <  1:1415664/69‑1 (MQ=255) aTCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCAtata  <  1:1396654/69‑1 (MQ=255) aTCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCAtata  <  1:1385517/69‑1 (MQ=255) aTCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCAtata  <  1:1366355/69‑1 (MQ=255) aTCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCAtata  <  1:126585/69‑1 (MQ=255) aTCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCAtata  <  1:122658/69‑1 (MQ=255) aTCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCAtata  <  1:1205887/69‑1 (MQ=255) aTCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTCTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCAtata  <  1:778185/69‑1 (MQ=255)   cccACAGGATGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCAtata  <  1:1296707/67‑1 (MQ=255)        aGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCAtata  <  1:890893/62‑1 (MQ=255)              aGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCAtata  <  1:489677/56‑1 (MQ=255)                     ccTTTTTTGCGGCTTCACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCAtata  <  1:1297060/49‑1 (MQ=255)                                                                     | ATCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTTGCGGCTACACTATTTCCCTGATCTGATACTAATGCCATATA  >  W3110S.gb/2997023‑2997091

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑