Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3028918	3028974	57	36 [0]	[0] 183	ygfT	fused predicted oxidoreductase Fe‑S subunit and nucleotide‑binding subunit

CCAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCG  >  W3110S.gb/3028882‑3028917                                    | ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:817122/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:232951/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:345669/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:421900/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:436854/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:458373/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:603376/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:629566/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:690306/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:291851/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:820963/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:843195/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:84946/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:864082/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:876608/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:884961/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:927236/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:141425/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:117647/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:1217832/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:1229120/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:1233391/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:1326144/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:1368461/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:1379902/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:1381726/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:187691/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:1439632/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:1525477/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:1534086/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:1541827/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:1544533/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:1598357/36‑1 (MQ=255) ccAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTACGCAGCg  <  1:414/36‑1 (MQ=255)  cAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:855546/35‑1 (MQ=255)  cAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCg  <  1:1118497/35‑1 (MQ=255)                                    | CCAGACGGATGTAATCCGGAATAGCGTTATGCAGCG  >  W3110S.gb/3028882‑3028917

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑