Missing coverage evidence...
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CAAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCTTT  >  W3110S.gb/3044542‑3044596                                                       | caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:619602/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:352418/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:374608/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:391334/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:399826/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:402441/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:481018/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:481080/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:481613/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:52905/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:568219/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:306567/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:659712/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:661364/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:691183/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:692959/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:71298/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:738268/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:765839/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:812377/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:871850/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:1400737/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:105785/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:1062327/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:1179861/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:1220438/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:12396/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:1258810/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:127190/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:1300410/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:133328/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:1353803/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:1403160/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:1422410/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:1563966/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:234217/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:238798/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:28608/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:302188/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:306326/55‑1 (MQ=255) caAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACATATCttt  <  1:291620/55‑1 (MQ=255)     tGCTATAGCCATTTGTTTATCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCttt  <  1:1017425/51‑1 (MQ=255)                                                       | CAAGTGCTATAGCCATTTGTTTTTCCGAGAAAAATTAATTCGTTGACGTATCTTT  >  W3110S.gb/3044542‑3044596

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑