Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3096708	3096885	178	38 [0]	[0] 57	yggW	predicted oxidoreductase

GCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCGG  >  W3110S.gb/3096640‑3096707                                                                    | gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:797973/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:1013870/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:572833/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:633772/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:651115/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:671270/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:705725/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:748368/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:779565/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:796855/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:472136/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:802733/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:84571/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:84761/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:859752/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:935434/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:937479/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:989720/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:999785/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:1460641/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:1073555/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:118417/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:1191104/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:1204342/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:1207958/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:122194/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:1307279/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:1314004/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:1341022/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:463506/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:1580422/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:225273/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:240029/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:367006/68‑1 (MQ=255) gCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:399041/68‑1 (MQ=255) gCTTACGACAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:790619/68‑1 (MQ=255)             cccGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:394926/56‑1 (MQ=255)                    aTCATTGCCAGAACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCgg  <  1:1568420/49‑1 (MQ=255)                                                                    | GCTTACGCCAAACCCGGTTATCAGTGCCAGCACAATCTCAACTACTGGCGCTTTGGTGACTACATCGG  >  W3110S.gb/3096640‑3096707

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑