Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3103789	3103978	190	100 [0]	[0] 148	mltC	membrane‑bound lytic murein transglycosylase C

GGCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTAA  >  W3110S.gb/3103721‑3103788                                                                    | ggCAATTATGGAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:152510/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGGTGCGCTGGGATTaa  <  1:255157/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:364904/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:577433/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:552124/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:505869/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:49082/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:473558/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:473364/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:435793/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:434341/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:415283/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:400829/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:380001/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:597532/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:35799/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:301837/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:283122/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:276856/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:261227/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:234357/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1006061/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:211258/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:202045/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:820303/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:9926/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:979026/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:968377/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:95480/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:953576/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:914014/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:912106/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:89449/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:888410/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:865290/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:860721/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:224868/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:737473/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:722201/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:713306/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:688865/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:686142/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:675346/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:668964/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:661013/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:652035/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:604558/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:603497/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1141204/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1349506/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1320644/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1296484/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:195002/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1294459/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1290858/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1279546/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1250756/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1208087/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1197727/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1187678/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1296472/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1131133/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1118158/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1101394/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1100722/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1069775/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1061945/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1049363/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1038814/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1026362/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1020174/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1415847/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1474386/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1458566/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1445494/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1481374/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1435907/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1526436/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1544616/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:141813/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1564608/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1599982/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1389818/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1386763/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1380834/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1360264/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1354068/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1351651/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGACTaa  <  1:1241444/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTAAGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:102408/68‑1 (MQ=255) ggCAATTATGCAGACCGAATCTCCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:194015/68‑1 (MQ=255)  gCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:752201/67‑1 (MQ=255)  gCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:726256/67‑1 (MQ=255)  gCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1059240/67‑1 (MQ=255)  gCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:38078/67‑1 (MQ=255)  gCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:463498/67‑1 (MQ=255)    aaTTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCGGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1472890/65‑1 (MQ=255)    aaTTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:546501/65‑1 (MQ=255)               ccGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:1209273/54‑1 (MQ=255)                          tttAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTaa  <  1:699054/43‑1 (MQ=255)                                                                    | GGCAATTATGCAGACCGAATCTTCCTTTAACCCGTATGCGGTCAGCCGTTCCGATGCGCTGGGATTAA  >  W3110S.gb/3103721‑3103788

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑