Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3111882	3112396	515	87 [0]	[0] 21	[yghG]–[pppA]	[yghG],[pppA]

AATTCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTAAAAA  >  W3110S.gb/3111813‑3111881                                                                     | aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCTCCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1262198/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:457550/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:668036/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:650306/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:649952/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:638872/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:623069/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:5547/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:55348/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:528305/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:495105/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:484861/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:690078/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:453764/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:415014/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:407085/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:366757/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:35334/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:337552/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:336735/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:324546/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:310374/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:269088/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:818449/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:984235/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:965963/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:950612/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:906781/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:879819/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:877380/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:872547/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:848696/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:842551/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:827322/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:268356/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:808717/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:804518/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:771965/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:769929/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:762867/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:754364/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:735253/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:721113/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:707844/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1119501/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1003876/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1283274/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1247168/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1231791/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1195345/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1178135/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1147940/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1144558/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1136862/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1126437/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1289833/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1104217/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:110355/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1080485/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1074927/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1034472/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1031168/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1018815/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1013467/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1012971/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1498309/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:22969/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:223767/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:201850/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:198334/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:197362/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:173451/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:162297/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1587529/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1566125/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1312752/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:149712/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:146436/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1442830/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1420163/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1415471/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1354139/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1321890/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1321231/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1318046/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGACAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:1216848/1‑69 (MQ=255) aattCCCTCAGTGATCATTAATTTCACAGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTaaaaa  >  1:975980/1‑69 (MQ=255)                                                                     | AATTCCCTCAGTGATCATTAATTTCACCGTCGGGTCAGCGCACATTTGTCGTTGATAGCTGGTTAAAAA  >  W3110S.gb/3111813‑3111881

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑