Missing coverage evidence...
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GAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCACTG  >  W3110S.gb/3154889‑3154956                                                                 |    gAATGAAACACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:1545050/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:61200/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:307207/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:348177/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:362405/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:366453/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:42112/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:490098/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:508333/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:52576/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:580563/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:285894/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:640052/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:655098/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:655913/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:657215/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:684328/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:697169/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:713252/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:716806/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:994145/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:1399327/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:1100213/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:1144580/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:1154934/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:1173843/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:1212556/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:124130/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:1285000/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:1296063/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:1398845/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:1080435/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:149149/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:1503344/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:1518618/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:1554445/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:160164/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:22907/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCa     >  1:23479/1‑65 (MQ=255) gAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCACTg  >  1:200087/1‑68 (MQ=255)                                                                 |    GAATGAAAAACGCGATACCAAGCGCGCTAAGCTGCTGCAATATGCTGAACGCGTCTGGAACATCACTG  >  W3110S.gb/3154889‑3154956

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑