Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3184707 3186903 2197 162 [0] [0] 113 insC–[yqiG] insC,insD,[yqiG]

Only 100 of 162 total aligned reads displayed.

TTCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCAC  >  W3110S.gb/3184637‑3184706
                                                                     |
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACgac  <  1:1317239/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:454982/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:552540/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:551517/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:542641/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:529778/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:529755/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:511192/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:48694/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:473000/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:459299/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:456455/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:56612/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:389443/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:347137/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:337571/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:329954/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:298278/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:255574/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:246551/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:235099/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:940768/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:222193/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:195727/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:729566/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:928433/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:905591/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:895125/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:894296/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:88037/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:843601/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:837110/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:827126/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:803355/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:77414/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:754972/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:100253/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:726629/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:694235/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:693189/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:678576/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:663744/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:661703/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:636672/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:634946/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:615914/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:604444/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:978669/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:964412/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1269678/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1267183/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1242467/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1209874/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1208110/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1201461/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1186070/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1185752/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1184374/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1168338/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1323451/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:984405/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1001706/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1108129/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:108497/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:108201/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1066035/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1061261/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:103632/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1026567/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1019973/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1516541/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:173044/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:168909/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:168401/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:163336/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1606690/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1592174/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1587568/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1577342/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1563767/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1535758/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1486749/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1485409/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1457614/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:145433/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1450401/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:14256/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1412916/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1411784/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:942488/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1347485/69‑1 (MQ=255)
 tCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAAAAAACcac  <  1:207252/69‑1 (MQ=255)
 gcGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:935085/68‑1 (MQ=255)
  cGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:991553/68‑1 (MQ=255)
     ccGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGAGCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1355651/65‑1 (MQ=255)
              tcatTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1115687/56‑1 (MQ=255)
                         ttAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:233008/45‑1 (MQ=255)
                         ttAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1123881/45‑1 (MQ=255)
                            aTGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACcac  <  1:1286858/42‑1 (MQ=255)
                             tGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAATTTAAAATTAACcac  <  1:1140190/41‑1 (MQ=255)
                                                                     |
TTCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCAC  >  W3110S.gb/3184637‑3184706

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: