Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3188577	3188903	327	91 [0]	[0] 114	yqiH	predicted periplasmic pilin chaperone

TTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAG  >  W3110S.gb/3188508‑3188576                                                                     | ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGGAGCAGGAg  >  1:1349504/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:392726/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:584877/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:553204/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:533285/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:530851/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:526712/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:524755/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:510671/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:479748/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:469802/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:408589/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:587571/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:387220/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:385601/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:381003/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:378455/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:360767/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:358638/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:351436/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:347908/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:327905/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:311329/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:767690/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:990820/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:987433/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:983378/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:938031/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:928886/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:894797/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:887678/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:859986/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:807552/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:792476/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:789530/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:266089/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:72658/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:711968/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:694844/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:679182/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:673807/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:662098/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:629861/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:622485/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:616086/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:603841/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1168078/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1326260/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1318816/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1312251/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1286044/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1267073/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1262279/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1251060/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1223358/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1222276/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1192492/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1185894/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1344106/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:116074/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1153673/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1153022/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:110670/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1080582/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1077975/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:106280/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1058061/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1039623/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1034110/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1504013/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1021026/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:260383/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:221968/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:196358/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1591553/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1589541/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1566437/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1532291/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1527163/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:29784/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1470370/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:145272/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1450218/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1445327/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1442650/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1419580/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1412340/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:140958/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1380729/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1375204/1‑69 (MQ=255) ttAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGAGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAg  >  1:1527089/1‑69 (MQ=255)                                                                     | TTAGCCAAAATTAATTCAGGATGAAACTAATGCGCTACTTAAATACAAAGAATATCATTGCAGCAGGAG  >  W3110S.gb/3188508‑3188576

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑