Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3227147 3227307 161 139 [0] [0] 147 ygjJ conserved hypothetical protein

Only 100 of 139 total aligned reads displayed.

TATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATC  >  W3110S.gb/3227078‑3227146
                                                                    |
tATGACGTCAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:924475/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:352061/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:531467/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:529257/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:511172/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:482632/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:478678/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:470574/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:461755/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:456506/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:428461/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:424058/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:405850/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:386147/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:535809/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:344403/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:339042/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:29537/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:275758/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:255083/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:251146/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:244388/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1001327/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:23111/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:200640/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:805410/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:975212/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:972949/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:958321/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:943299/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:900177/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:875948/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:853582/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:851254/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:834325/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:82683/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:821018/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:239452/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:801553/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:796655/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:786128/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:775096/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:753938/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:744034/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:740140/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:721536/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:711328/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:674039/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:113356/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1316977/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1285887/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1270865/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1266893/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1216575/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1210788/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1194873/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1182076/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1168255/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1152956/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1144827/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1312658/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1130811/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1126063/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1123960/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1106839/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1092798/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1074663/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1065918/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1061955/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1048133/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1028392/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:102529/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1342674/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1537600/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1533551/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1510866/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1505204/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1492867/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1478826/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1478060/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1476282/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1472013/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1459095/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1454956/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:143811/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1416870/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1416210/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1375916/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1368781/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1350056/69‑1 (MQ=255)
tATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1327919/69‑1 (MQ=255)
tATGACCACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:123524/69‑1 (MQ=255)
 aTGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:441512/68‑1 (MQ=255)
 aTGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:652618/68‑1 (MQ=255)
 aTGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:623218/68‑1 (MQ=255)
 aTGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1604608/68‑1 (MQ=255)
 aTGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1547400/68‑1 (MQ=255)
   gacgacAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:1489450/66‑1 (MQ=255)
         aaaTACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:354133/60‑1 (MQ=255)
             acacCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATc  <  1:287771/56‑1 (MQ=255)
                                                                    |
TATGACGACAAATACACCTATCCGGCAATGATGAACGGTTACATCCAGTATGACCTTGCCGAAGGCATC  >  W3110S.gb/3227078‑3227146

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑