Missing coverage evidence...
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CTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTA  >  W3110S.gb/3227340‑3227408                                                                     | cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:689149/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:1587847/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:1000752/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:244140/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:251272/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:512310/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:518155/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:572363/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:577014/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:671920/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:169885/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:720994/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:852635/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:874444/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:877347/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:931551/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:944954/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:96371/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:966681/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:96922/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:127313/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:100348/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:1022977/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:1057815/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:1075293/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:1079715/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:1123750/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:1213254/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:1222080/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:1241417/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:126192/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:1571357/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:1297947/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:1299550/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:1347936/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:1360848/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:1457596/69‑1 (MQ=255) cTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:1552641/69‑1 (MQ=255)      acCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:493946/64‑1 (MQ=255)       ccTACGCCAAACATCGCCGTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:564343/63‑1 (MQ=255)          aCGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:1279046/60‑1 (MQ=255)            gCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTa  <  1:550893/58‑1 (MQ=255)                                                                     | CTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCTGACGATGAAACCACCTCTTTCATGCAGTTTGGTA  >  W3110S.gb/3227340‑3227408

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑