Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	250411	250755	345	25 [0]	[0] 121	mbhA	ECK0231:JW5812:b0230; flagellar system protein, promoterless fragment

CCCCAGGGATTACGCGTGCTGATTAAAGACGACCAGAACCGCAATATGTTTGAACGC  >  W3110S.gb/250354‑250410                                                         | ccccAGGGATTACGCGTGCTGATTTAAGACGACCAGAACCGCAATATGTTTGAAcgc  <  1:1403957/57‑1 (MQ=255) ccccAGGGATTACGCGTGCTGATTAAAGACGACCAGAACCGCAATATGTTTGAAtgc  <  1:1398038/57‑1 (MQ=255) ccccAGGGATTACGCGTGCTGATTAAAGACGACCAGAACCGCAATATGTTTGAAcgc  <  1:1565812/57‑1 (MQ=255) ccccAGGGATTACGCGTGCTGATTAAAGACGACCAGAACCGCAATATGTTTGAAcgc  <  1:968574/57‑1 (MQ=255) ccccAGGGATTACGCGTGCTGATTAAAGACGACCAGAACCGCAATATGTTTGAAcgc  <  1:914551/57‑1 (MQ=255) ccccAGGGATTACGCGTGCTGATTAAAGACGACCAGAACCGCAATATGTTTGAAcgc  <  1:888532/57‑1 (MQ=255) ccccAGGGATTACGCGTGCTGATTAAAGACGACCAGAACCGCAATATGTTTGAAcgc  <  1:759936/57‑1 (MQ=255) ccccAGGGATTACGCGTGCTGATTAAAGACGACCAGAACCGCAATATGTTTGAAcgc  <  1:71252/57‑1 (MQ=255) ccccAGGGATTACGCGTGCTGATTAAAGACGACCAGAACCGCAATATGTTTGAAcgc  <  1:676578/57‑1 (MQ=255) ccccAGGGATTACGCGTGCTGATTAAAGACGACCAGAACCGCAATATGTTTGAAcgc  <  1:659395/57‑1 (MQ=255) ccccAGGGATTACGCGTGCTGATTAAAGACGACCAGAACCGCAATATGTTTGAAcgc  <  1:636378/57‑1 (MQ=255) ccccAGGGATTACGCGTGCTGATTAAAGACGACCAGAACCGCAATATGTTTGAAcgc  <  1:474747/57‑1 (MQ=255) ccccAGGGATTACGCGTGCTGATTAAAGACGACCAGAACCGCAATATGTTTGAAcgc  <  1:35655/57‑1 (MQ=255) ccccAGGGATTACGCGTGCTGATTAAAGACGACCAGAACCGCAATATGTTTGAAcgc  <  1:306628/57‑1 (MQ=255) ccccAGGGATTACGCGTGCTGATTAAAGACGACCAGAACCGCAATATGTTTGAAcgc  <  1:294945/57‑1 (MQ=255) ccccAGGGATTACGCGTGCTGATTAAAGACGACCAGAACCGCAATATGTTTGAAcgc  <  1:1030481/57‑1 (MQ=255) ccccAGGGATTACGCGTGCTGATTAAAGACGACCAGAACCGCAATATGTTTGAAcgc  <  1:1558517/57‑1 (MQ=255) ccccAGGGATTACGCGTGCTGATTAAAGACGACCAGAACCGCAATATGTTTGAAcgc  <  1:1504033/57‑1 (MQ=255) ccccAGGGATTACGCGTGCTGATTAAAGACGACCAGAACCGCAATATGTTTGAAcgc  <  1:14633/57‑1 (MQ=255) ccccAGGGATTACGCGTGCTGATTAAAGACGACCAGAACCGCAATATGTTTGAAcgc  <  1:143383/57‑1 (MQ=255) ccccAGGGATTACGCGTGCTGATTAAAGACGACCAGAACCGCAATATGTTTGAAcgc  <  1:133506/57‑1 (MQ=255) ccccAGGGATTACGCGTGCTGATTAAAGACGACCAGAACCGCAATATGTTTGAAcgc  <  1:1269585/57‑1 (MQ=255) ccccAGGGATTACGCGTGCTGATTAAAGACGACCAGAACCGCAATATGTTTGAAcgc  <  1:1135006/57‑1 (MQ=255)  cccAGGGATTACGCGTGCTGATTAAAGACGACCAGAACCGCAATATGTTTGAAcgc  <  1:1122525/56‑1 (MQ=255)          ttACGCGTGCTGATTAAAGACGACCAGAACCGCAATATGTTTGAAcgc  <  1:1074387/48‑1 (MQ=255)                                                         | CCCCAGGGATTACGCGTGCTGATTAAAGACGACCAGAACCGCAATATGTTTGAACGC  >  W3110S.gb/250354‑250410

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑