Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3321978	3322160	183	78 [0]	[0] 165	[leuU]–[secG]	[leuU],[secG]

CGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTACCACC  >  W3110S.gb/3321909‑3321977                                                                     | cGTCTTTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:166451/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGTACTTGAACACGTAATCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:793949/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:373227/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:547822/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:546833/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:50980/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:486095/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:464349/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:441693/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:412896/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:379140/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:588267/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:371660/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:360095/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:304820/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:289672/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:286657/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:253906/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:242262/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:829764/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:973947/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:970345/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:939260/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:913134/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:896677/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:896442/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:894463/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:874772/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:572200/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:795404/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:754663/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:742527/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:737404/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:677057/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:615938/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:610781/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:1034047/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:1289449/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:1472586/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:1382134/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:135628/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:1318466/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:131548/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:1314963/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:1312382/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:1305070/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:1289613/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:234793/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:1266911/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:1266200/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:125930/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:1218849/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:1082852/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:1080766/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:1063461/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:1047465/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:1003949/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:1564459/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:21319/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:208732/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:193111/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:16028/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:1597044/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:215610/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:1586524/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:238411/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:1555412/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:1536144/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:152961/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:1527834/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:1517661/69‑1 (MQ=255) cGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:1519846/69‑1 (MQ=255)  gTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:980642/68‑1 (MQ=255)  gTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:952510/68‑1 (MQ=255)  gTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:30825/68‑1 (MQ=255)  gTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:520312/68‑1 (MQ=255)                  ttGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:376117/52‑1 (MQ=255)                          gAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTaccacc  <  1:413187/44‑1 (MQ=255)                                                                     | CGTCTCTTTTCTGGAATTTGGTACCGAGGACGGGACTTGAACCCGTAAGCCCTATTGGGCACTACCACC  >  W3110S.gb/3321909‑3321977

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑