Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3327437	3328426	990	76 [0]	[0] 69	[rrmJ]–[greA]	[rrmJ],yhbY,[greA]

GGTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCTTT  >  W3110S.gb/3327368‑3327436                                                                     | ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:405291/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:566710/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:551608/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:54804/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:509581/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:508720/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:496820/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:485510/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:467602/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:467374/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:599862/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:391444/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:37001/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:337682/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:324063/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:315857/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:305486/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:289545/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:255411/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:753223/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:991363/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:990034/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:960186/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:95243/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:921601/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:913833/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:796124/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:792918/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:77307/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:24593/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:750112/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:738974/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:731850/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:710094/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:70680/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:66290/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:64367/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:606525/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1257287/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1389772/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1346904/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1319037/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1316447/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1308902/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1296533/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1295238/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1283500/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1261390/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1415981/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1197829/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1148994/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1143997/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1133072/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1114020/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1083265/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1074026/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1045420/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1505259/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:240511/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:226413/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:222708/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:210867/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:194889/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:157041/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1546019/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1532499/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1520397/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1017329/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1505133/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1496267/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1491436/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1459392/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1452522/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1450129/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1446633/1‑69 (MQ=255) ggTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCttt  >  1:1420225/1‑69 (MQ=255)                                                                     | GGTTTAAAGAGTTTGTCACTTTGCTGTATTTCATCAAGTTTAAACCAGGCACGGGAACGTAACCCCTTT  >  W3110S.gb/3327368‑3327436

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑