Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3420801	3420980	180	100 [0]	[0] 193	yhdX	predicted amino‑acid transporter subunit

CTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTTA  >  W3110S.gb/3420732‑3420800                                                                     | gcttAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:517724/67‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATTGTTTTAATTCCTTAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:433790/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:329238/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:506642/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:44582/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:441619/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:438368/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:433608/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:412496/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:389691/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:33306/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:525894/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:31942/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:316163/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:301792/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:283957/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:239524/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:223390/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:210208/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:201190/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:183802/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:18033/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:760485/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:977937/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:969829/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:963478/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:954993/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:926759/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:926336/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:897246/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:808788/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:803111/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:781195/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1039152/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:756316/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:73225/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:7049/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:697242/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:631459/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:62205/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:573312/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:547939/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:543681/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1165925/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1271657/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1261966/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1236439/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1234021/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1233776/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:122027/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1219179/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1179629/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1170463/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1228551/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1159140/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1147148/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1139924/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1129387/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1113680/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1083957/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:107736/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1063852/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1038709/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1290016/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1476093/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:147226/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1431553/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1531688/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1336733/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1328228/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1600409/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1304760/69‑1 (MQ=255) cTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1601352/69‑1 (MQ=255)  tttAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:154831/68‑1 (MQ=255)  tttAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:952786/68‑1 (MQ=255)  tttAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:901040/68‑1 (MQ=255)  tttAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:128428/68‑1 (MQ=255)  tttAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1124950/68‑1 (MQ=255)  tttAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:839599/68‑1 (MQ=255)  tttAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1507645/68‑1 (MQ=255)  tttAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:770753/68‑1 (MQ=255)  tttAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:292701/68‑1 (MQ=255)  tttAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1166910/68‑1 (MQ=255)  tttAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1418350/68‑1 (MQ=255)  tttAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:310606/68‑1 (MQ=255)  tttAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1171317/68‑1 (MQ=255)  tttAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:656599/68‑1 (MQ=255)  tttAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:625877/68‑1 (MQ=255)  tttAACTTCCGCGGCGGGATGGGTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:280745/68‑1 (MQ=255)   ttAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:10950/67‑1 (MQ=255)      aCTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:445411/64‑1 (MQ=255)       cTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:768629/63‑1 (MQ=255)               gcggGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1503403/55‑1 (MQ=255)               gcggGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1311229/55‑1 (MQ=255)                  ggATGGTTTTAATTCCTGATCTGGCAGCCTTAACGCTGTCACTTTCGGTTta  <  1:925387/52‑1 (MQ=255)                          ttAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:568874/44‑1 (MQ=255)                          ttAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1607068/44‑1 (MQ=255)                           tAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:930832/43‑1 (MQ=255)                             aTTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1554401/41‑1 (MQ=255)                                  tGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTta  <  1:1498931/36‑1 (MQ=255)                                                                     | CTTTAACTTCCGCGGCGGGATGGTTTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTTA  >  W3110S.gb/3420732‑3420800

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑