Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3447755	3447772	18	82 [0]	[0] 49	rpoC	RNA polymerase, beta prime subunit

CTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGCC  >  W3110S.gb/3447686‑3447754                                                                     | cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCTCCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1169632/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:420655/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:579637/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:526943/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:515926/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:513530/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:498823/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:48361/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:471804/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:46859/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:434144/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:623122/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:413401/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:393347/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:367978/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:336478/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:336319/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:269493/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:266185/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:221176/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:774493/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:993112/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:954456/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:900043/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:889850/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:869993/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:854203/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:822459/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:813099/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:781531/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:582223/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:764029/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:688110/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:672999/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:642254/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:637809/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:631170/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:62496/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1032373/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1303993/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1373623/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1362689/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1071034/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1085070/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1166358/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1352501/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1341557/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1333242/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1382618/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1261731/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1250208/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1230088/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1223225/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1187144/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1185285/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1179707/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1174909/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1041777/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:214189/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1019036/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:167770/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1597321/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1590297/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1565856/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1556089/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1534392/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1484004/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1481355/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1441538/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1425703/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1424668/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1414000/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1054127/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:140538/69‑1 (MQ=255) cTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCCGACGcc  <  1:205640/69‑1 (MQ=255)  ttCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1358206/68‑1 (MQ=255)   tCCGGACCGGCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:24760/67‑1 (MQ=255)            tCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:569353/58‑1 (MQ=255)                aaaTTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:844794/54‑1 (MQ=255)                   ttACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:498611/51‑1 (MQ=255)                    tACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:1353961/50‑1 (MQ=255)                        tCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGcc  <  1:396512/46‑1 (MQ=255)                                                                     | CTTCCGGACCGTCGGAAATTACGTCACCACGTTCTACACGTTCACCTTCGAACACGTTGAGCTGACGCC  >  W3110S.gb/3447686‑3447754

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑