Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3450535	3450579	45	63 [0]	[0] 118	rpoC	RNA polymerase, beta prime subunit

TCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCG  >  W3110S.gb/3450466‑3450534                                                                     | tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:52140/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:540624/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:1519825/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:1555426/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:1593982/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:1600186/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:539092/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:208361/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:246686/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:269492/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:276024/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:146096/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:477442/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:340022/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:3755/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:37754/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:380608/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:471999/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:395348/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:408147/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:412387/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:444959/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:1437406/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:1027476/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:1062803/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:1072776/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:1140348/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:967907/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:1152757/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:921609/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:1178150/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:1195069/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:811749/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:1267820/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:1292312/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:1301997/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:1372308/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:78614/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:587032/69‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:1434741/69‑1 (MQ=255)  ccGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:537312/68‑1 (MQ=255)  ccGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:793215/68‑1 (MQ=255)  ccGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:767968/68‑1 (MQ=255)  ccGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:678176/68‑1 (MQ=255)  ccGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:988399/68‑1 (MQ=255)  ccGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:1408471/68‑1 (MQ=255)  ccGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:1042457/68‑1 (MQ=255)  ccGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:1147901/68‑1 (MQ=255)  ccGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:116562/68‑1 (MQ=255)  ccGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:1219512/68‑1 (MQ=255)  ccGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:123721/68‑1 (MQ=255)  ccGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:381274/68‑1 (MQ=255)  ccGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:1433756/68‑1 (MQ=255)  ccGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:1473376/68‑1 (MQ=255)  ccGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:190/68‑1 (MQ=255)  ccGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:286943/68‑1 (MQ=255)  ccGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:296832/68‑1 (MQ=255)   cGGCGCAGACAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:1384590/67‑1 (MQ=255)      cgcAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:1419795/64‑1 (MQ=255)       gcAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:864293/63‑1 (MQ=255)                    gcagACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:306424/50‑1 (MQ=255)                       gACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:526091/47‑1 (MQ=255)                         cGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCg  <  1:940830/45‑1 (MQ=255)                                                                     | TCCGGCGCAGCCAGATCCAGCAGACGTTTCAGACGGTTGTTACGGTTAATGACGCGACGATACAGATCG  >  W3110S.gb/3450466‑3450534

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑