Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3457668 3457978 311 95 [0] [0] 16 [rplA]–[rplK] [rplA],[rplK]

ACCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAC  >  W3110S.gb/3457599‑3457667
                                                                    |
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGGTTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:321420/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:426158/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:591072/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:580387/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:577310/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:570061/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:554493/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:515230/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:495934/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:485906/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:470575/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:464169/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:456703/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:602507/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:414594/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:408988/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:390685/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:325344/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:30904/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:282650/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:277353/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1050096/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:254645/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:74753/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:981679/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:973314/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:940146/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:924859/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:904015/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:897442/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:800708/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:798933/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:769120/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:765530/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:254684/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:711088/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:693057/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:691985/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:674266/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:669305/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:62471/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:621434/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:619770/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:610711/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:603213/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1234447/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1384431/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:22843/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1354650/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1353808/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1337814/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1337333/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1322432/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1320977/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1277864/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1266238/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:126117/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1357491/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1215146/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1189122/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1186410/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1181298/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1159315/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1148044/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1134241/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1117190/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1085334/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1085222/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1410897/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:204565/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:189740/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1600683/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1585252/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1566853/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1562957/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1544550/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1538125/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1533113/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1515476/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:151052/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1492674/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1469925/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:143591/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1434183/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1427632/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1416648/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGGCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:197500/69‑1 (MQ=255)
aCCGTGCGGCAGAACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:640689/69‑1 (MQ=255)
 ccGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1176334/68‑1 (MQ=255)
 ccGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:916103/68‑1 (MQ=255)
          aGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGATGTTAAc  <  1:2258/59‑1 (MQ=255)
           gTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:1397925/58‑1 (MQ=255)
              cAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:823116/55‑1 (MQ=255)
                 ttGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:554331/52‑1 (MQ=255)
                          gtacgtTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAc  <  1:306904/43‑1 (MQ=255)
                                                                    |
ACCGTGCGGCAGTACAGTTGCACCACGTACGTTCTGGTCAGATTTACGAGCGTCGATGCCGAGGTTAAC  >  W3110S.gb/3457599‑3457667

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: