Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3483740	3483755	16	83 [0]	[0] 64	ppc	phosphoenolpyruvate carboxylase

ACATTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAACC  >  W3110S.gb/3483671‑3483739                                                                     | acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:457900/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:590490/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:567071/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:558120/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:557464/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:545122/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:542596/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:532043/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:523925/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:490467/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:465362/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:600755/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:445881/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:400251/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:38165/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:364643/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:357820/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:313467/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:261370/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:237649/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:232179/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:748664/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:985064/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:945437/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:914305/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:903615/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:852080/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:837924/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:826846/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:77920/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:758406/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:225028/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:727231/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:700501/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:67581/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:668395/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:662564/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:659330/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:642178/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:640403/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:621602/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1210973/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1005542/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1341077/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1339215/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1332812/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1299463/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1292086/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1259763/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1230229/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1225489/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1356758/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1207446/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1190445/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1154091/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1118846/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1108016/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1087556/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1073060/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1064643/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1005778/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1527487/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:223231/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:210801/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:194636/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:192728/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1599564/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1583070/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1562224/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1530229/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1374403/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1518300/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1516249/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1492052/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1449431/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1436216/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1433066/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1416333/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1414388/69‑1 (MQ=255) acaTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1383093/69‑1 (MQ=255)  caTTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1007111/68‑1 (MQ=255)                tAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:1572240/54‑1 (MQ=255)                    aaCTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAAcc  <  1:614302/50‑1 (MQ=255)                                                                     | ACATTCTTGAACGCGTAGAAACTATCCGTAAGTTGTCGAAATCTTCACGCGCTGGCAATGATGCTAACC  >  W3110S.gb/3483671‑3483739

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑